2016年12月8日，全国基层卫生技能竞赛进入复赛阶段的最后一个环节——操作技能比赛。本次活动考察重点均在这个环节得到最具体的体现，包括全科诊疗思维、团队协作能力、解决常见问题的技能等。上午进行个人操作技能比赛，每人30分钟，下午进行团体操作技能比赛，每支团队45分钟。

经过培训，40名来自医学院校、医院、疾控中心和基层医疗卫生机构的专家担任操作技能比赛的考官。考官助手在上一组选手操作完成后，为下一组选手复原操作物品。为了给选手营造真实的操作场景，组委会为选手提供标准体检者。考试期间，设巡考专家，随时解决比赛过程中的突发问题。设监督员，监督比赛的全过程，确保公平、公正。

操作技能环节是参与工作人员最多的一个环节，约有120名工作人员。首都医科大学、北京大学第一医院等单位给予大力支持。